Amidasa (AMD)
Entzimak:Katalizatzaile biologiko makromolekulak dira, entzima gehienak proteinak dira
Amidasa:Hainbat amida alifatiko eta aromatiko endogeno eta arrotzen hidrolisia katalizatzea, azil talde bat urari transferituz, azido libreak eta amoniakoa sortuz. Azido hidroxamikoak eta beste azido organiko batzuk asko erabiltzen dira sendagai gisa, hazkuntza faktoreen, antibiotikoen eta tumore inhibitzaileen osagaiak direlako. Amidasak R motako eta S motako azilasetan bana daitezke katalizatzailearen estereoselektibitatearen arabera.
Amiden hidrolisia katalizatzeaz gain, amidasak azil transferentzia erreakzioak ere kataliza ditzake hidroxilamina bezalako ko-substratuen aurrean.
Iturri ezberdinetako amidasek substratu espezifikotasun desberdina dute, batzuek amida aromatikoak bakarrik hidroliza ditzakete, beste batzuek amida alifatikoak bakarrik hidroliza ditzakete, eta beste batzuek α- edo ω-amino amidak hidroliza ditzakete. Amina gehienek amida aromatiko azikliko edo sinpleetarako bakarrik dute jarduera katalitiko ona, baina aromatiko konplexuetarako, amida heteroziklikoek, batez ere orto ordezkatzaileak dituzten amidek, oro har jarduera txikia dute (entzima gutxi batzuek baino ez dituzte efektu katalitiko hobeak erakusten).
Mekanismo katalitikoa:
| Entzimak | Produktuaren kodea | Produktuaren kodea |
| Entzima hautsa | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | 19 amidasa multzo bat, 50 mg bakoitza 19 elementu * 50 mg / elementu, edo beste kantitate bat |
| Baheketa-kita (SynKit) | ES-AMD-1900 | 19 amidasako multzo bat, 1 mg bakoitza 19 elementu * 1 mg / elementu |
★ Substratuarekiko espezifikotasun handia.
★ Selektibitate kiral handia.
★ Bihurketa-eraginkortasun handia.
★ Azpiproduktu gutxiago.
★ Erreakzio-baldintza arinak.
★ Ingurumena errespetatzen duena.
➢ Entzimen baheketa substratu espezifikoetarako egin behar da, substratuaren espezifikotasunagatik, eta substratua efektu katalitiko onenarekin katalizatzen duen entzima bat lortu.
➢ Ez jarri inoiz kontakturik muturreko baldintzekin, hala nola: tenperatura altua, pH altua/baxua eta kontzentrazio handiko disolbatzaile organikoa.
➢ Normalean, erreakzio-sistemak substratua eta buffer-disoluzioa (entzimaren erreakzio-pH optimoa) izan behar ditu. Hidroxilamina bezalako ko-substratuak egon behar dira azil transferentzia erreakzio-sisteman.
➢ AMD erreakzio-sisteman azkenik gehitu behar da, erreakzio-pH eta tenperatura optimoekin.
➢ AMD mota guztiek erreakzio-baldintza optimo desberdinak dituzte, beraz, bakoitza banan-banan aztertu beharko litzateke.
1. adibidea(1):
Amida substratu ezberdinekiko hidrolisi jarduera
| Substratua | Jarduera espezifikoa μmol min-1mg-1 | Substratua | Jarduera espezifikoa μmol min-1mg-1 |
| Azetamida | 3.8 | ο-OH bentzamida | 1.4 |
| Propionamida | 3.9 | p-OH bentzamida | 1.2 |
| Laktamida | 12.8 | ο-NH2bentzamida | 1.0 |
| Butiramida | 11.9 | p-NH2bentzamida | 0,8 |
| Isobutiramida | 26.2 | ο-Toluamida | 0,3 |
| Pentanamida | 22.0 | p-Toluamida | 8.1 |
| Hexanamida | 6.4 | Nikotinamida | 1.7 |
| Ziklohexanamida | 19,5 | Isonikotinamida | 1.8 |
| Akrilamida | 10.2 | Pikolinamida | 2.1 |
| Metakrilamida | 3.5 | 3-Fenilpropionamida | 7.6 |
| Prolinamida | 3.4 | Indol-3-azetamida | 1.9 |
| Bentzamida | 6.8 |
Erreakzioa 50 mM-ko sodio fosfato buffer disoluzioan, pH 7,5ean, 70 ℃-tan egin zen.
| Amidak | Hidroxilamina | Hidrazina |
| Azetamida | 8.4 | 1.4 |
| Propionamida | 18.4 | 3.0 |
| Isobutiramida | 25.0 | 22,7 |
| Bentzamida | 9.2 | 6.1 |
Erreakzioa 50 mM-ko sodio fosfato buffer disoluzioan, pH 7,5ean, 70 ℃-tan egin zen.
Erreaktiboen kontzentrazio erlazionatua: amidak, 100 mM (bentzamida, 10 mM); hidroxilamina eta hidrazina, 400 mM; entzima 0,9 μM.
2. adibidea(2):
3. adibidea(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., et al. Extremophiles, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR, etab. Prozesuen Biokimika, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM, etab. Kimika Bioorganikoa, 2017, Sarean eskuragarri 7.
